Para atualizar o cpanel rode em seu SSH:
/scripts/upcp --force
# Atualizar todos os scripts do cPanel
/scripts/updatenow
# Atualizar para a última versão MySQL suportada
/scripts/mysqlup –force
# Atualizar o e-mail para a última versão
/scripts/exim4 –force
# Corrigir possíveis falhas
/scripts/fixeverything
# Reiniciar o WHM / cPanel
/etc/init.d/cpanel restart